1、樣本管的種類：
     現(xiàn)在主要有0.2ml和0.5ml兩種，使用0.5ml PCR管的人員已經(jīng)很少了，一是0.5ml PCR專用的薄壁管很少見，催化劑評(píng)價(jià)裝置生產(chǎn)商二是如果想要較大體積的PCR產(chǎn)物，可以通過多分幾個(gè)0.2ml PCR管來實(shí)現(xiàn)。 除非經(jīng)常需要較大體積的PCR產(chǎn)物，否則可以不必考慮0.5ml型的PCR儀  
2、樣本容量：
     種類很多，0.2ml的有96孔和48孔，0.5ml的有60孔和30孔，384孔等，催化劑評(píng)價(jià)裝置生產(chǎn)商當(dāng)然還有一些其他組合：如0.2ml的48孔與0.5ml的30孔組合。
3、溫度梯度功能：
     即不同列或不同行之間溫度可以為不同的溫度。這一功能對(duì)于固定PCR程序的檢驗(yàn)人員來講，催化劑評(píng)價(jià)裝置生產(chǎn)商可能用處不大，但對(duì)于經(jīng)常進(jìn)行不同基因擴(kuò)增的研究人員來講可以說是必須的。
4、計(jì)算控溫與模塊控溫：
  模塊控溫是早期PCR儀所使用的控溫方式，即所設(shè)定的溫度為加熱模塊的溫度，在變溫過程中，催化劑評(píng)價(jià)裝置生產(chǎn)商快要達(dá)到目標(biāo)溫度時(shí)，PCR儀將升降溫速率降低，讓模塊的溫度慢慢接近目的溫度，而不發(fā)生過沖。計(jì)算控溫也稱為管式控溫，即考慮的是PCR反應(yīng)管中的溫度，為了加快使反應(yīng)管中溫度達(dá)到目的溫度，模塊溫度先過沖，然后在反應(yīng)管中溫度接近達(dá)到目的溫度時(shí)調(diào)節(jié)到合適的溫度，調(diào)節(jié)方式是通過理論計(jì)算與實(shí)驗(yàn)相結(jié)合而來的，與反應(yīng)管中的反應(yīng)液的體積有關(guān)，因此計(jì)算控溫模式都需要實(shí)驗(yàn)人員輸入反應(yīng)液的體積。計(jì)算控溫模式已經(jīng)是普遍采用的方式了。